Для защиты от угона автомобиль оснащён:

• центральным замком;
• системой независимой блокировкой грузового пространства;
• супер блокировкой;
• камерой заднего вида для автоматического отображения на сенсорном экране задней части автомобиля при открытых дверях.

Для защиты водителя и пассажиров, новый PEUGEOT Boxer предлагает различные системы активной и пассивной безопасности. В их число входят:

• Система контроля загрузки автомобиля (LAC, Load Adaptive Control) активизирует систему ESP в зависимости от загруженности автомобиля и распределения веса груза. Таким образом, повышается устойчивость автомобиля в критических ситуациях.
• Антипробуксовочная система (ASR, anti-slip regulation) - тоже часть функции ESP. Эта система обнаруживает прокручивание на одном или обоих ведущих колёсах и воздействует на тормоза и обороты двигателя, чтобы восстановить сцепление с дорогой. На низкой скорости ASR помогает начать движение, особенно на скользкой поверхности. Система помогает автомобилю двигаться плавно, без рывков, и одновременно бережёт сцепление, что увеличивает срок его службы. На более высоких скоростях эта система помогает избежать пробуксовки колёс, особенно при резком ускорении на скользких поверхностях;
• Система предупреждения о смене полосы (LDWS, Lane Departure Warning System) постоянно получает сведения о дороге, используя камеру над зеркалом заднего вида. Если водитель пересекает сплошную или прерывистую разметку без использования указателей поворота, на панели появляется контрольный световой сигнал, а раздаётся звуковой сигнал о пересечении разметки с той стороны, где должно произойти пересечение. Это новое оборудование входит в стандартный пакет на 4-тонных фургонах, но также доступно в качестве опции на других комплектациях модели в пакете опций «Безопасность»;
• Датчик давления в шинах (DSG, Detection de Sous Gonflage – TPMS, Tyre Pressure Monitoring System). На каждом колесе расположены датчики давления, и в случае потери давления или прокола колеса, на приборной панели или центральном экране появляется сообщение о неполадке;
• Пассажирская подушка безопасности, боковые подушки безопасности и две дополнительные подушки безопасности также могут быть добавлены к комплектации;

Новый PEUGEOT Boxer также имеет следующие системы безопасности и помощи при вождении:

• Система помощи при старте на подъеме (Hill Start Assist) - также часть системы ESP. Эта функция активизируется на подъеме более 5%, когда автомобиль неподвижен, двигатель работает, нога водителя на педали тормоза, и включена 1-я передача (для подъёма вверх) или задняя передача (для спуска вниз). В этих условиях тормоз придерживается около 2 секунд после того, как водитель отпустил педаль тормоза. Это обеспечивает более уверенное движение и лёгкость на старте без риска скатиться в противоположном направлении –  и всё это независимо от загруженности транспортного средства;
• Интеллектуальная антипробуксовочная система (ITC, Intelligent Traction Control) доступна в качестве дополнительной опции. Она обеспечивает улучшенное сцепление на скользких поверхностях, таких как грязь, снег и лёд. Когда система активизируется кнопкой на приборной панели, она определяет уровень сцепления с дорогой, переключает на себя антипробуксовочную систему и передает привод на колесо с лучшим сцеплением. Это помогает оптимизировать тягу и поддержать нужную траекторию движения. Система автоматически отключается на скорости выше 30 км/ч.
• Эта же система ITC теперь включает ещё одну новую функцию – систему помощи при спуске (HDC, Hill Descent control). Эта функция может быть активизирована нажатием кнопки на приборной панели. Она позволяет водителю поддерживать постоянную скорость ниже 30 км/ч и контролировать автомобиль на резком спуске (наклон от 8%), особенно если дорога грязная или неровная. Эта система работает даже без нажатия на педали газа или тормоза. Но система автоматически отключается, когда водитель увеличивает скорость до 30 км/ч.